按照微生物對能源物質(zhì)和碳源物質(zhì)的利用情況不同，可將其分為以下4種：光能自養(yǎng)型、光能異養(yǎng)型、化能自養(yǎng)型和化能異養(yǎng)型。

   1、光能自養(yǎng)型

      光能自養(yǎng)型微生物以光為能源，利用二氧化碳或碳酸鹽作為碳源，以水或還原態(tài)無機(jī)物作為供氫體同化二氧化碳，常見的光能自養(yǎng)型微生物有藻類、藍(lán)細(xì)菌和大多數(shù)光合細(xì)菌等。

  2、光能異養(yǎng)型

   光能異養(yǎng)型微生物以光為能源，利用簡單有機(jī)物（如有機(jī)酸、醇等）為供氫體來同化二氧化碳。紫色非硫細(xì)菌，如紅微菌屬等即是這種營養(yǎng)類型。有機(jī)物在這里除用作氫或電子供體外，也可被直接同化利用。

  3、化能自養(yǎng)型

    化能自養(yǎng)型微生物的能量來自于還原態(tài)無機(jī)化合物氧化所產(chǎn)生的化學(xué)能，碳源是二氧化碳或碳酸鹽，可在*是無機(jī)物的環(huán)境中生長。常見的化能自養(yǎng)型微生物包括硝化細(xì)菌、硫化細(xì)菌、鐵細(xì)菌合氫細(xì)菌等。

  4、化能異養(yǎng)型

    化能異養(yǎng)型微生物以有機(jī)物為能源和碳源，氮源可以是無機(jī)的，也可以是有機(jī)的。這類微生物的種類和數(shù)量都很多，包括絕大多數(shù)細(xì)菌和放線菌、幾乎全部的真菌和原生動(dòng)物以及病毒等。